Phần 2 tiếp tục sau khi The Ark sụp đổ, những người cầm quyền cũng như toàn bộ con người đang trú ngụ trên vệ tinh cuối cùng này cận kề cái chết bắt buộc phải quay về trái đất vì hết oxy dự trữ. Họ không thể đợi đến khi sứ mạng thử nghiệm của 100 tù nhân hoàn tất nữa. Câu chuyện sẽ diễn ra như thế nào?
Liệu từ giờ ai sẽ là người lãnh đạo khi 100 tù nhân trước đây phải chịu sự chỉ huy của những người cầm quyền trên The Ark giờ đây lại có những kinh nghiệm sống sót trên trái đất hơn hẳn họ ?